Ghost Squad da Sega para Wii é um jogo de tiro em primeira pessoa. Você joga como membro de uma unidade antiterrorista chamada Ghost Squad, cujo objetivo é atirar em terroristas e resgatar reféns. O jogo tem apenas três fases, mas muitos desbloqueáveis permitem jogá-las de várias formas. O modo Arcade principal é para um ou dois jogadores, mas os modos Treino e Festa permitem até quatro.
Os controles de Ghost Squad são simples. Principalmente, o botão B do Wii Remote é o de tiro e o botão A é o de ação (mas você pode invertê-los nas configurações). Se estiver usando o Wii Zapper, B é o tiro e Z é a ação. Pressione o botão de tiro enquanto mira o controle na tela e aponte para fora da tela para recarregar. Para outras ações, existem diferentes formas de usar o botão de ação. Segurá-lo é melhor para resgatar reféns, enquanto pressioná-lo rapidamente funciona melhor para desarmar minas. A tecla + faz você voltar ao jogo se seu personagem morrer.
A tarefa principal em cada uma das três fases é matar todos os terroristas. Outras tarefas dependem do caminho escolhido. Os múltiplos caminhos têm tarefas como encontrar reféns, desarmar bombas, dar cobertura para sua equipe e diferentes tipos de assaltos. Ao completar cada missão, o jogo desbloqueia novos níveis de complexidade para a próxima vez; existem 16 níveis de complexidade para cada missão. Cada missão também tem um chefe no final. A primeira é em uma vila com o chefe Alex Havoc em um helicóptero. A Missão Dois é a bordo do Air Force One com "Laccard Zimone" na baía de carga no final. A Missão Três é na selva com um chefe lançador de foguetes chamado Dingo.
Ao completar missões continuamente, seu personagem avança de posto. Sua primeira promoção vem no Nível 4; outras em níveis selecionados à medida que avança de Recruta até Marechal no Nível 99. Avançar de nível também desbloqueia novas armas, dando novos tipos de pistolas, fuzis e metralhadoras. O jogo fica muito mais fácil ao atingir o Nível 38 e o posto de General de Brigada, quando você ganha a Metralhadora TR14. Avançar também desbloqueia várias roupas, incluindo Policial, Durão, Cowboy, Virtua Cop e Guerreiro Futurista. Se jogar e completar as Missões no Modo Festa, o jogo desbloqueia o Modo Ninja, onde você joga shurikens nos inimigos em vez de atirar. Complete esse modo e desbloqueará o Modo Paraíso, onde você atira com pistolas de água em modelos de biquíni.