"Yu-Gi-Oh! GX Duel Academy" para Game Boy Advance permite que os jogadores escolham e personalizem vários personagens na escola Duel Academy. Este jogo de 2006 baseado na série animada requer que os jogadores colem cartas e vençam duelos com seus decks. Tutoriais e questionários ajudam os jogadores a dominar a jogabilidade. Os controles do jogo são fáceis de dominar, tornando este um título apropriado para jogadores mais jovens.
Tela do Deck: Remova uma carta com o botão "L". Adicione uma carta com o botão "R". Pressione "Start" para ver uma carta.
Durante Duelos: Acesse o menu de fases com o botão "B". Troque a câmera com o botão "R". Segure "R" para ver uma carta. Pause o jogo com "Start" durante duelos e veja o tempo total de jogo segurando "Select".
Na Loja: Pressione "Cima" ou "Baixo" no direcional para escolher um pacote. Pressione "Esquerda" para adicionar um pacote à cesta. Pressione "Direita" para remover. Esvazie a cesta com "L" e encha com "R". Pressione "Start" para ver descrição do pacote e "Select" para acessar a tela de ajuda.
Abrindo Pacotes: Pressione "A" para acelerar a abertura do pacote, ou "B" para ir para a tela de confirmação da carta. Abra o próximo pacote com "R".
Calendário: Veja o próximo mês no menu do calendário com "R". Veja o mês anterior pressionando "L".
Máquina de Senha: Escolha um número movendo o direcional "Cima" ou "Baixo". Mova o cursor para trocar de número pressionando "Esquerda" ou "Direita".