Jogadores de Pokémon Emerald provavelmente conhecem Rayquaza pela arte da capa. Rayquaza é um Pokémon verde, robótico e serpentino que batalha em sua forma selvagem no nível 70. Como lendário, oferece luta difícil. Rayquaza é forte contra Fogo, Inseto, Lutador, Água e Planta. Para batalhar eficazmente, uma party ideal consiste em: um Pokémon do tipo Gelo para causar muito dano, um do tipo Dragão ou Pedra para baixar a vida de Rayquaza até a faixa de captura sem matá-lo, e pelo menos um Pokémon de alto nível (cerca de 70) com golpe de paralisia.
Compre a Mach Bike na loja de bicicletas em Mauville City. A loja fica à direita do Centro Pokémon. A Acro Bike é mais fácil de controlar, mas a Mach Bike tem a velocidade necessária para alcançar Rayquaza.
Capture um Pokémon com habilidade Sleep (Sono) ou Sing (Canto), como Altaria. Treine este Pokémon até nível 70 para que tenha efeito em Rayquaza.
Voe para Pacifidlog Town e use Surf para leste até o Sky Pillar. Estoque o máximo de Ultra Balls possível. Salve o jogo antes de entrar no Sky Pillar.
Entre no Sky Pillar. Cada andar tem um grande vão no centro, com entrada de um lado e saída do outro. Use a Mach Bike para passar rápido por rachaduras no chão. No quarto andar, pilote a Mach Bike ao redor da entrada até as rachaduras diretamente acima do vão, onde rochas impedem progresso. O chão quebrará e o personagem cairá no andar anterior. Entre na porta antes bloqueada por rochas. Continue pelos andares até o último, onde Rayquaza paira no centro.
Batalhe contra o Rayquaza selvagem até sua vida estar no amarelo baixo ou vermelho. Pokémon Dragão e Pedra causam dano duplo; tipo Gelo causa dano quádruplo. Quando Rayquaza estiver com pouca vida, use Sing ou outra habilidade paralisante até que não possa agir ou fugir.
Jogue tantas Ultra Balls quanto necessário para capturar Rayquaza, ou uma única Master Ball para capturá-lo imediatamente.