Um dos Pokémon mais poderosos da franquia é Mewtwo, um Pokémon psíquico geneticamente aprimorado e extremamente inteligente. Em Pokémon Emerald Version, após derrotar a Elite Four e acessar a Battle Frontier, Mewtwo pode dar grande vantagem. A única forma de obtê-lo é trocando de FireRed Version ou LeafGreen Version via cabo Game Boy Advance.
Jogue Pokémon Emerald até derrotar a Elite Four e obter a National Pokédex do Prof. Oak. Isso permite coletar Pokémon de versões anteriores.
Capture ou encontre qualquer Pokémon que esteja disposto a trocar para seu jogo FireRed ou LeafGreen.
Vá ao Pokémon Center mais próximo e salve. Pode desligar e remover o cartucho.
Jogue FireRed ou LeafGreen até obter a National Dex (após capturar 60 tipos e derrotar a Elite Four).
Vá à Cerulean Cave com um Pokémon que saiba Surf. Desça até o fundo (andar B2) para encontrar Mewtwo. Salve antes da batalha. A maioria usa a Master Ball, mas pode enfraquecê-lo com ataques e status antes de usar outras Poké Balls.
Salve no Pokémon Center mais próximo.
Insira FireRed ou LeafGreen em um GBA e Emerald no outro. Conecte com o cabo link. Ligue ambos se estiverem desligados.
Vá ao andar de trocas do Pokémon Center em ambos os jogos e inicie a troca. Siga as instruções para trocar Mewtwo para seu Emerald em troca do Pokémon capturado antes.