Mewtwo é um Pokémon lendário nível 70 escondido no fim do labirinto da Unknown Dungeon (Caverna Desconhecida). Para chegar lá, primeiro derrote a Elite Quatro. Também deve já ter entregue o Rubi e a Safira para Celio, o homem que opera a máquina na Ilha 1. Pode usar sua Master Ball para capturar Mewtwo ou tentar com Ultra Balls.
Estoque Ultra Balls se quiser guardar a Master Ball ou já a usou.
Vá a Cerulean, passe pela Nugget Bridge e surfe para o lado esquerdo da tela para achar a entrada da Unknown Dungeon.
Lá dentro, surfe até a extrema direita e vá à plataforma inferior para entrar no labirinto.
Navegue no labirinto. Ordem: baixo, direita, cima, direita, cima, esquerda, baixo, direita, cima. Se correto, achará uma escada.
Use a escada e navegue no 2º andar. Ordem: esquerda, baixo, direita, baixo.
Pegue o caminho da direita na bifurcação para achar a segunda escada.
Desça à terceira escada, logo abaixo da segunda. Isso o colocará no caminho direto a Mewtwo.
Salve o jogo ao encontrar Mewtwo.
Batalhe com sua melhor equipe. Use Master Ball para captura rápida. Caso contrário, baixe HP ao máximo antes de jogar Ultra Balls. Se optar por Ultra Balls, levará tempo e paciência.