Entre na caverna e equipe suas flores de bomba no menu Start. Pressione "A" para colocá-las e destruir a parede à frente. Vá para a direita até uma escada. Suba, caminhe até encontrar uma porta e exploda com flores de bomba.
Entre na porta e siga o caminho até ver estátuas Armos. Empurre as estátuas para cobrir o interruptor no chão, permitindo subir ao segundo nível da sala e abrir a porta lá.
Atravesse a porta para uma sala com ilhas flutuando na lava. Pule de ilha em ilha até a porta do outro lado. Abra, equipe o graveto Deku no menu "Start" e entre na próxima sala. Encoste na tocha para acender o graveto e corra pela sala acendendo os três tochas apagadas.
Entre na porta que abre e siga até ver um interruptor. Pise nele para desbloquear uma porta do outro lado. Vá até lá, encontre uma escada. Suba e verá uma porta bloqueada. Abra com flor de bomba. Abra o baú para encontrar o Mapa da Masmorra.
Vá à porta desbloqueada antes e abra. Siga até uma escada inacessível com flores de bomba ao redor. Coloque uma sua para detonar todas, baixando a escada. Suba e à direita encontrará outra sala.
Entre na sala e mova o objeto bem na frente da escada para poder subir. Lá em cima há um interruptor. Pise e passe pela porta para a próxima sala. Atravesse a ponte e pule do outro lado. Procure um bloco cinza, puxe um pouco e suba nele; encontrará um baú cheio de flores de bomba, que pode jogar na porta do outro lado para abri-la.
Entre na próxima sala, equipe sua funda no menu Start e atire no olho pendurado acima do fogo, apagando-o. Vá à próxima área e atire em outro olho à esquerda da primeira plataforma onde pode pular. Corra rápido à próxima sala e pule o vão. Do lado direito haverá um baú cheio de bombas. Pegue e continue.
Encontre o interruptor no chão na próxima sala e pise. Vá à ponte à direita e jogue bombas nos dois buracos. Eles levam aos olhos de um crânio gigante abaixo. Quando ambos os olhos ficarem vermelhos, poderá pular na boca e acessar a próxima área.
Vá para a direita até uma sala cheia de blocos. Suba nos blocos para chegar ao outro lado, onde há potes. Vá em frente e verá um bloco solto. Segure "A" para empurrar o bloco para baixo, em direção ao centro e no interruptor no chão. Isso leva à sala final antes do chefe.
Vá ao baú no final da sala, que contém mais bombas. Coloque uma bomba no centro para revelar um buraco. Pule no buraco para acessar o chefe da Caverna de Dodongo.