Pokémon Shadow só podem ser encontrados em dois jogos "Pokémon": "Pokémon Colosseum" e "Pokémon XD". Pokémon Shadow diferem dos Pokémon tradicionais no sentido de que podem ser roubados dos seus treinadores e podem não lhe obedecer por vezes devido ao seu coração não estar desbloqueado. Para remover o bloqueio final de qualquer Pokémon Shadow, deve aumentar o seu medidor de coração e depois purificar o Pokémon com uma Cerimónia de Purificação.
Coloque o Pokémon Shadow na sua equipa e deixe-o lá permanentemente.
Use o Pokémon em batalha para aumentar o seu medidor de coração. Ocasionalmente, pode entrar em "Modo Hiper" e ignorar os seus comandos. Ao chamá-lo com o comando "Chamar" (Call), pode tirar o Pokémon do "Modo Hiper" e aumentar significativamente o seu medidor de coração.
Encha completamente o medidor de coração. Após algumas batalhas, o medidor de coração deve estar no máximo. Uma vez cheio, leve o Pokémon ao Santuário de Celebi em Agate Town. Lá, uma breve cutscene ocorrerá e o Pokémon será purificado.