Pokémon Yellow Version: Special Pikachu Edition foi lançado pela Nintendo em outubro de 1999 exclusivamente para o Game Boy. Os jogadores devem coletar e treinar diferentes tipos de Pokémon. Durante o jogo, são acompanhados por Pikachu, que auxilia no progresso. O jogo também contém um minijogo de surfe com Pikachu, e existem vários truques para ganhar vantagens e desbloquear segredos.
Alguns itens e elementos extras não estão disponíveis no início e devem ser desbloqueados. Os jogadores podem obter um diploma especial do designer do jogo. Para isso, complete toda a Pokédex. Uma vez completa, vá à Mansão Celadon, onde o designer premiará com o Diploma da Pokédex. Mew é o único Pokémon que não precisa estar presente para obter o diploma. O minijogo de surfe do Pikachu é desbloqueado usando Pikachu para vencer todas as partidas do Torneio Pokémon Stadium. Após vencer, visite um homem na casa de praia de Fuchsia City que desbloqueará o jogo de surfe.
Ao longo do jogo, os jogadores enfrentam batalhas não programadas quando oponentes se escondem na grama e atacam ao passar. Para evitar essas batalhas, use a HM Cut. Uma vez encontrada, a HM Cut ajuda diferentes Pokémon a cortar grama. Quando um Pokémon aprende o golpe HM Cut, pode cortar a grama ao encontrá-la, fazendo os inimigos fugirem e as batalhas desaparecerem.
Personagens Pokémon geralmente precisam ser persuadidos para ganhar afeição. Em Yellow Version, os jogadores podem ganhar a admiração de Pikachu pulando o processo normal. Adquira Pikachu em sua Pokébola. Neste momento, você deve ter uma poção inicial. Se usar a poção cinco vezes consecutivas na Pokébola de Pikachu antes da batalha contra o colecionador rival Gary Eevee, a afeição de Pikachu começará imediatamente após a derrota de Eevee. Se Eevee vencer, a poção não terá efeito.