O Nintendo 64 (N64) saiu em 1997. Trazia muitos jogos desenvolvidos pela Nintendo e terceiros, mas alguns dos mais populares eram jogos de tiro. Permitiam controlar agentes secretos, soldados ou aliens e atirar através de fases cheias de inimigos.
Alguns shooters estrelam o agente secreto britânico James Bond. "GoldenEye" baseia-se no filme de 1995. FPS onde você impede um agente traidor de dominar o mundo. Pode controlar tanque e lutar com várias pistolas e rifles. Notável pelo multiplayer para até 4 jogadores em arenas especiais.
"Perfect Dark" tem jogabilidade similar a "GoldenEye", mas no futuro; estrela a agente Joanna Dark. Fases incluem Area 51 e Air Force One, com multiplayer 4 jogadores e modo treino. "Turok 2: Seeds of Evil" se passa na Terra Perdida (Lost Land), mundo mítico com dinossauros e inimigos. Controla Joshua Fireseed, caçador de dinossauros humano contra força antiga protegendo totens de energia místicos. Também tem multiplayer.
O N64 tem vários jogos da franquia "Star Wars" de George Lucas. Em "Rogue Squadron", ambientado na época da Aliança Rebelde dos filmes, controla Luke Skywalker em cenários como escolta e resgate. Em cada, pilota nave em níveis sobre mundos alienígenas. "Star Wars: Battle for Naboo" se passa durante "A Ameaça Fantasma". Shooter de naves explorando trama por trás do filme, joga como Tenente Sykes, desconhecido, livrando Naboo do mal.
Outros shooters em mundos alienígenas. "Jet Force Gemini" da Rare traz dupla de soldados fofos e seu cachorro. Objetivo single-player: explorar locais 3D para resgatar criaturas alienígenas chamadas tribals. Tem deathmatch multiplayer e modo cooperativo 2 jogadores. "Body Harvest" coloca você na pele de soldado contra raça de aliens insetoides. Cada fase em ponto diferente da história, locais incluem EUA e ilha de Java. Luta a pé ou comanda veículos como aviões e barcos, e resolve puzzles.