A série anime Naruto se passa num mundo cheio de ninjas coloridos e ataques exagerados. A série de jogos de luta Naruto: Ultimate Ninja segue a tradição, permitindo controlar Naruto, Sasuke e outros favoritos. Desbloquear todas técnicas secretas é difícil pois requer desbloquear cada uma jogando com personagem diferente. Leva muito tempo e paciência.
Complete modo "story". Isso desbloqueará Anko, Anbu Kakashi, Asuma, Hanabi Hyuuga, Konohamaru, Kurenai e "Might Suit" Naruto. Cada personagem tem técnicas secretas, então todos precisam ser desbloqueados. Também dará dinheiro suficiente para ajudar no modo "RPG".
Complete modo RPG. Mais personagens, incluindo Yellow Flash, serão desbloqueados. No caminho, desbloqueará técnicas secretas de outros personagens completando missões. Namore outros personagens conversando com eles. Isso desbloqueia suas técnicas.
Vença os "free acts" do RPG. São histórias extras não inclusas no RPG normal. Mais personagens e técnicas serão desbloqueados.
Vença missões "ranqueadas" com cada personagem para level up. Suas técnicas finais serão desbloqueadas ao atingir level máximo.